MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-5

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011408	GGT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916818
2	NC_011408	GGGA	2	8	64	71	25 %	0 %	75 %	0 %	209916818
3	NC_011408	GAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
4	NC_011408	GAA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
5	NC_011408	GCC	2	6	195	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916818
6	NC_011408	GGA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916818
7	NC_011408	A	7	7	257	263	100 %	0 %	0 %	0 %	209916818
8	NC_011408	TAC	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916818
9	NC_011408	TCC	2	6	473	478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916818
10	NC_011408	GAAAC	2	10	493	502	60 %	0 %	20 %	20 %	209916818
11	NC_011408	CGG	2	6	654	659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916818
12	NC_011408	ACGG	2	8	703	710	25 %	0 %	50 %	25 %	209916818
13	NC_011408	AG	4	8	736	743	50 %	0 %	50 %	0 %	209916818
14	NC_011408	ACG	2	6	768	773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
15	NC_011408	CAG	2	6	778	783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
16	NC_011408	GGA	2	6	865	870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916818
17	NC_011408	A	6	6	878	883	100 %	0 %	0 %	0 %	209916818
18	NC_011408	GAT	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916818
19	NC_011408	GCA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
20	NC_011408	CGG	2	6	1018	1023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916818
21	NC_011408	GAA	2	6	1043	1048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
22	NC_011408	GAA	2	6	1122	1127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
23	NC_011408	CAG	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
24	NC_011408	AGC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
25	NC_011408	AGA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916818
26	NC_011408	CAG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916818
27	NC_011408	GAGC	2	8	1396	1403	25 %	0 %	50 %	25 %	209916818
28	NC_011408	AG	3	6	1447	1452	50 %	0 %	50 %	0 %	209916818
29	NC_011408	GGAACG	2	12	1491	1502	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	209916818
30	NC_011408	TGT	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916820
31	NC_011408	GCC	2	6	1706	1711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916820
32	NC_011408	TCA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916821
33	NC_011408	GT	3	6	1885	1890	0 %	50 %	50 %	0 %	209916821
34	NC_011408	ATT	2	6	1892	1897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916821
35	NC_011408	T	6	6	1928	1933	0 %	100 %	0 %	0 %	209916821
36	NC_011408	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	209916821
37	NC_011408	TATG	2	8	2155	2162	25 %	50 %	25 %	0 %	209916821
38	NC_011408	CAAG	2	8	2187	2194	50 %	0 %	25 %	25 %	209916821
39	NC_011408	GTT	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916821
40	NC_011408	T	7	7	2263	2269	0 %	100 %	0 %	0 %	209916821
41	NC_011408	TATG	2	8	2277	2284	25 %	50 %	25 %	0 %	209916821
42	NC_011408	T	8	8	2309	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	209916821
43	NC_011408	A	6	6	2327	2332	100 %	0 %	0 %	0 %	209916821
44	NC_011408	GTTT	2	8	2376	2383	0 %	75 %	25 %	0 %	209916821
45	NC_011408	AAC	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916821
46	NC_011408	A	6	6	2448	2453	100 %	0 %	0 %	0 %	209916821
47	NC_011408	TTTA	2	8	2575	2582	25 %	75 %	0 %	0 %	209916821
48	NC_011408	CAT	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916821
49	NC_011408	TC	4	8	2702	2709	0 %	50 %	0 %	50 %	209916821
50	NC_011408	ATG	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916821
51	NC_011408	GTT	2	6	2788	2793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916821
52	NC_011408	AATC	2	8	2827	2834	50 %	25 %	0 %	25 %	209916822
53	NC_011408	ATT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916822
54	NC_011408	ATC	2	6	2903	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916822
55	NC_011408	T	8	8	2914	2921	0 %	100 %	0 %	0 %	209916822
56	NC_011408	TGA	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916822
57	NC_011408	TAT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916822
58	NC_011408	TC	4	8	2997	3004	0 %	50 %	0 %	50 %	209916822
59	NC_011408	TC	4	8	3041	3048	0 %	50 %	0 %	50 %	209916822
60	NC_011408	GAT	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916822
61	NC_011408	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916822
62	NC_011408	T	7	7	3079	3085	0 %	100 %	0 %	0 %	209916822
63	NC_011408	TCT	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916822
64	NC_011408	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916822
65	NC_011408	ACC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916822
66	NC_011408	T	6	6	3128	3133	0 %	100 %	0 %	0 %	209916822
67	NC_011408	A	7	7	3143	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	209916822
68	NC_011408	TTTTC	2	10	3172	3181	0 %	80 %	0 %	20 %	209916822
69	NC_011408	GCT	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916822
70	NC_011408	T	8	8	3208	3215	0 %	100 %	0 %	0 %	209916822
71	NC_011408	TTG	2	6	3292	3297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916822
72	NC_011408	TCT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916822
73	NC_011408	CTTTC	2	10	3359	3368	0 %	60 %	0 %	40 %	209916822
74	NC_011408	G	6	6	4396	4401	0 %	0 %	100 %	0 %	209916823
75	NC_011408	TTC	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916823
76	NC_011408	CCGCC	2	10	4482	4491	0 %	0 %	20 %	80 %	209916823
77	NC_011408	CGC	2	6	4509	4514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916823
78	NC_011408	AT	3	6	4559	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	209916823
79	NC_011408	CTG	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916823
80	NC_011408	GCC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916823
81	NC_011408	T	6	6	4602	4607	0 %	100 %	0 %	0 %	209916823
82	NC_011408	AT	3	6	4878	4883	50 %	50 %	0 %	0 %	209916824
83	NC_011408	T	6	6	4971	4976	0 %	100 %	0 %	0 %	209916824

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.